MacBook Airの環境を入れ替えたついでに、MAMPを最新の2.1.1に入れ替えました。
PukiWikiのデータやhttpd.conf、php.iniなどの修正済み環境は以前の環境から移したのですが、ブラウザからhttp://localhost:8888へアクセスしても何も表示されません。MAMPのテストページは表示されるし、Apacheのログにもエラーが見当たらないのでPHPを疑うしかありません。
環境設定から、PHPタブを選択して PHPのバージョンを5.4.4から5.2.17に変更してみると何事もなかったようにPukiWikiが表示されるようになりました。
本当はもうちょっと調べればちゃんとした回避策があるのでしょうが、今は時間がないのでこの方法で逃げておこうと思います。